Transmutacja to metoda łączenia zbędnych modyfikacji w celu uzyskania gatunkowo lepszych (po uiszczeniu stosownej opłaty w kredytach). Czasami jest to jedyny sposób uzyskania ekskluzywnych modyfikacji, aczkolwiek Skażone Mody, Aury, zachowania Strażników, Wzmocnienia oraz mody Eventowe nie mogą być nabyte tą metodą.
Nie istnieje określona kombinacja, dzięki której można wytworzyć określoną modyfikację. Wpływ na efekt transmutacji ma szczęście wykonawcy oraz rzadkość modyfikacji, chociaż polaryzacja i podobieństwo modów jest również czynnikiem zwiększającym szansę na wytworzenie modyfikacji o konkretnych parametrach.