Rdzeń Transmutacyjny Madurai to specjalna odmiana rdzenia używany jako element procesu Transmutacji. Użycie Rdzenia Madurai sprawia, że modyfikacja uzyskana w procesie Transmutacji będzie miała polaryzację . Rdzeń usuwa również koszt procesu Transmutacji. Rdzeń nie zapewnia rzadkości modyfikacji, a jedynie jej polaryzację.
Rdzeń Transmutacyjny może być zakupiony za 10 000 w syndykacie Cefalon Simaris.