Navigationskoordinaten oder Nav-Koordinaten sind Ressourcen, welche üblicherweise in jeder Art von Containern gefunden werden können. Sie ähneln den Energiekugeln, nur mit dem Unterschied, dass sie wesentlich dunkler sind.
Navigationskoordinaten werden benötigt, um Schlüssel für das Orokin Wrack herstellen zu können. Mit diesen Schlüsseln ist es möglich, die Missionen des Wracks zu betreten - abgesehen von der Attentatsmission.
Um Koordinaten effizient zu sammeln, sollten Mods wie Diebesgespür oder Meisterdieb benutzt werden, damit sämtliche Container auf der Umgebungskarte angezeigt werden. Außerdem ist es sinnvoll, niederstufige Missionen mit vielen Containern (bspw. Caloris auf Merkur) abzuschließen, um die Ausbeute zu erhöhen.
Es ist nicht möglich Navigationskoordinaten im Markt für 
Platinum zu erwerben.
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Um die Attentatsmission im Orokin Wrack betreten zu können, muss ein spezieller Schlüssel hergestellt werden. Um diesen in der Schmiede bauen zu können, werden sogenannte Lephantis Navigationskoordinaten benötigt. Dieses sind ausschließlich in den übrigen Missionen, wie Verteidigung oder Gefangennahme, des Wracks zu finden.
In der Attentatsmission muss es der Spieler mit dem Boss Lephantis aufnehmen, für dessen Tötung man die Blaupausen für den Warframe Nekros erhält.
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Die neuen Mutalist Nav-Koordinaten die für den Bau der Attentatsmission ( Mutalist Alad V ) benötigt werden, sind bei Befallenen Invasionen als Battle-Pay zu erhalten. Diese Invasionen muss man meist 3 mal wiederholen um die Mutalist Nav-Koordinaten zu erhalten. Aber diese Invasionen sind sehr selten, deswegen sind diese Nav-Koordinaten auch so wertvoll.Ebenfalls wird sie bei Orokin Wrack Verteidigung und Überleben (Rotation B) gedroppt.
